Ton cas d'exemple est mal tourné Tenshirock, non?
Bizarre, j'ai l'impression que avec ou sans le pas, ça fonctionne!
Ce ne sont que des radis? Là on se dit, finalement ce n'est rien d'autre que des radis!
Ce ne sont pas que des radis? Ce qui porte à penser, que ce n'est pas que des radis
Car le "Ne sont-ce que des radis?" est une interrogative de cette affirmative "Ce ne sont que des radis". Là dans ton exemple tu as fait d'une affirmative, une interrogative via le ? qui n'était pas nécessaire pour le sens de la phrase.
"Ce ne sont que des radis" - "Ce ne sont pas que des radis." Dans les deux cas, on constate quelquechose, le "pas" étant un marqueur pour insister sur un doute.
"Ce ne sont que des radis" = La personne est sûre d'elle et affirme que ce sont des radis.
"Ce ne sont pas que des radis" = La personne constate qu'il y'a des radis mais qu'il peut y'avoir autre chose, le "pas" annulant la certitude de n'avoir que des radis.
Donc si on met tout ça en interrogative, ce ferait:
"Ce ne sont que des radis" devient "Ne sont-ce pas que des radis"? = on garde la certitude
"Ce ne sont pas que des radis" devient "Ne sont-ce pas que des radis?" = on garde le doute
Donc selon-moi, dans une interrogative de ce genre, le "pas" peut avoir un double sens.